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Bibliotecas de variantes
Anticuerpos
Soluciones compatibles con las IVDR
Twist Bioscience HQ
681 Gateway Blvd
South San Francisco, CA 94080
Cobertura uniforme y detección segura de variantes
Produzca bibliotecas coherentes y de alta calidad para flujos de trabajo de enriquecimiento de dianas para secuenciación de última generación (NGS) con el kit de preparación de bibliotecas TrueAmp. Impulsado por la polimerasa TrueAmp Twist y optimizado para la fragmentación enzimática, este flujo de trabajo ofrece una alta eficiencia de conversión y un bajo sesgo de GC. Estas características proporcionan una cobertura equilibrada en regiones genómicas difíciles y la precisión necesaria para una caracterización fiable de las variantes.
Uniformidad fiable en regiones difíciles
Mejore la coherencia de la cobertura para reducir la pérdida relacionada con AT y GC. Garantice una mejor representación de regiones genómicas difíciles para obtener resultados de secuenciación más completos.
Conversión eficiente de muestras
Maximice el rendimiento de la biblioteca a partir de muestras de baja entrada, fijadas en formol e incluidas en parafina (FFPE), y de calidad variable. Conserve el preciado material de partida y minimice la necesidad de repetir análisis.
Amplificación de alta fidelidad
Minimice los errores inducidos por la amplificación y el sesgo con la polimerasa TrueAmp Twist. Consiga una detección precisa de variantes de baja frecuencia para aumentar la confianza en cada detección.
Datos del producto
El kit de preparación de bibliotecas TrueAmp ofrece un mayor rendimiento previo a la captura, tamaños de biblioteca uniformes y una cobertura media del objetivo más sólida a partir de ADN FFPE degradado y de baja entrada, lo que preserva la complejidad de la biblioteca y aumenta los resultados de secuenciación fiables en las muestras difíciles.
Figura 1. Comparación del rendimiento de bibliotecas enriquecidas con muestras degradadas FFPE de baja entrada (DIN <2,2) entre el kit de preparación de bibliotecas TrueAmp y el kit K de la competencia, lo que revela que es la solución óptima para aplicaciones con muestras difíciles. (A) El kit de preparación de bibliotecas TrueAmp Twist obtiene un rendimiento superior de las bibliotecas antes de la captura, lo que indica una construcción de bibliotecas y eficiencia de amplificación elevadas. (B) El kit de preparación de bibliotecas TrueAmp Twist muestra una mayor complejidad de las bibliotecas que los kits de la competencia. Esto permite secuenciar en la biblioteca más moléculas de ADN individuales, lo que reduce los costes de secuenciación. (C) Logra una mayor cobertura.
El kit de preparación de bibliotecas TrueAmp Twist consigue una mayor uniformidad de cobertura y menos regiones con cobertura cero. La reducción de las pérdidas del objetivo aumenta la confianza en una secuenciación coherente de las regiones críticas.
Figura 2. Comparación del rendimiento de bibliotecas enriquecidas con muestras degradadas FFPE de baja entrada (DIN <2,2) entre el kit de preparación de bibliotecas TrueAmp y el kit K de la competencia, lo que revela que es la solución óptima para aplicaciones con muestras difíciles. (A) Ofrece una excelente uniformidad de cobertura, medida a través de una menor penalización por base “fold-80”. (B) Reducción de las regiones sin cobertura, medidas según el porcentaje de objetivos con cero cobertura.
La mezcla de polimerasas TrueAmp Twist obtiene una cobertura más uniforme en las regiones de GC alto y bajo, lo que mantiene el rendimiento incluso al aumentar los ciclos de PCR.
Figura 3. Rastreo del sesgo de GC normalizado que muestra una mejor cobertura de la polimerasa TrueAmp Twist. Las bibliotecas se prepararon con el kit de preparación de bibliotecas TrueAmp Twist y se amplificaron con diferentes polimerasas y ciclos. Panel superior: Gráficos de cobertura normalizada frente a ventana de GC para comparar las polimerasas al cabo de 3 ciclos de PCR. Panel inferior: Gráficos de cobertura normalizada frente a ventana de GC para comparar las polimerasas al cabo de 16 ciclos de PCR.
El kit de preparación de bibliotecas TrueAmp Twist consigue tamaños de fragmentos de bibliotecas de ADN uniformes y un rendimiento suficiente en una amplia gama de entradas de muestras, lo que permite flujos de trabajo de entrada mixtos a la vez que se mantiene una cobertura uniforme y resultados reproducibles a escala.
Figura 4. Tamaño fiable de la biblioteca con el kit de preparación de bibliotecas TrueAmp Twist, incluso a partir de entradas ultrabajos. Se fragmentaron 500 ng, 100 ng, 50 ng, 10 ng y 1 ng (ADNg) a 32 °C. Se utilizaron 3, 5, 6, 8, 10 y 14 ciclos de PCR para la amplificación, respectivamente. Las muestras se realizaron por duplicado. (A) Electroferogramas de bibliotecas NGS generados con el kit de preparación de bibliotecas TrueAmp Twist. (B) Concentración de bibliotecas después de la amplificación con diversas entradas de ADN.
El kit de preparación de bibliotecas TrueAmp Twist ofrece tamaños de fragmentos de bibliotecas de ADN repetibles con una amplia gama de cantidades de entrada que respaldan la confianza en los resultados de la secuenciación y los análisis posteriores.
Figura 5. Regulabilidad del kit de preparación de bibliotecas TrueAmp de Twist. (A) Cinco electroferogramas de bibliotecas de NGS generadas con diferentes tiempos de fragmentación. Se fragmentaron 50 ng de ADNg de alta calidad durante diversos tiempos a 32 °C. Se utilizaron 6 ciclos de PCR para la amplificación. (B) Mediana del tamaño del inserto frente al tiempo. Se fragmentaron 50 ng de ADNg de alta calidad durante distintos tiempos a 32 °C. La amplificación se realizó mediante 6 ciclos de PCR. Las muestras se capturaron utilizando el panel Twist Exome 2.0.
Vídeo
Alto rendimiento y cobertura cuando las muestras son más difíciles
El kit de preparación de bibliotecas TrueAmp ofrece un mayor rendimiento previo a la captura, tamaños de biblioteca uniformes y una cobertura media del objetivo más sólida a partir de ADN FFPE degradado y de baja entrada, lo que preserva la complejidad de la biblioteca y aumenta los resultados de secuenciación fiables en las muestras difíciles.
Figura 1. Comparación del rendimiento de bibliotecas enriquecidas con muestras degradadas FFPE de baja entrada (DIN <2,2) entre el kit de preparación de bibliotecas TrueAmp y el kit K de la competencia, lo que revela que es la solución óptima para aplicaciones con muestras difíciles. (A) El kit de preparación de bibliotecas TrueAmp Twist obtiene un rendimiento superior de las bibliotecas antes de la captura, lo que indica una construcción de bibliotecas y eficiencia de amplificación elevadas. (B) El kit de preparación de bibliotecas TrueAmp Twist muestra una mayor complejidad de las bibliotecas que los kits de la competencia. Esto permite secuenciar en la biblioteca más moléculas de ADN individuales, lo que reduce los costes de secuenciación. (C) Logra una mayor cobertura.
Cobertura uniforme con menor pérdida de objetivos
El kit de preparación de bibliotecas TrueAmp Twist consigue una mayor uniformidad de cobertura y menos regiones con cobertura cero. La reducción de las pérdidas del objetivo aumenta la confianza en una secuenciación coherente de las regiones críticas.
Figura 2. Comparación del rendimiento de bibliotecas enriquecidas con muestras degradadas FFPE de baja entrada (DIN <2,2) entre el kit de preparación de bibliotecas TrueAmp y el kit K de la competencia, lo que revela que es la solución óptima para aplicaciones con muestras difíciles. (A) Ofrece una excelente uniformidad de cobertura, medida a través de una menor penalización por base “fold-80”. (B) Reducción de las regiones sin cobertura, medidas según el porcentaje de objetivos con cero cobertura.
Cobertura mejorada en extremos de GC
La mezcla de polimerasas TrueAmp Twist obtiene una cobertura más uniforme en las regiones de GC alto y bajo, lo que mantiene el rendimiento incluso al aumentar los ciclos de PCR.
Figura 3. Rastreo del sesgo de GC normalizado que muestra una mejor cobertura de la polimerasa TrueAmp Twist. Las bibliotecas se prepararon con el kit de preparación de bibliotecas TrueAmp Twist y se amplificaron con diferentes polimerasas y ciclos. Panel superior: Gráficos de cobertura normalizada frente a ventana de GC para comparar las polimerasas al cabo de 3 ciclos de PCR. Panel inferior: Gráficos de cobertura normalizada frente a ventana de GC para comparar las polimerasas al cabo de 16 ciclos de PCR.
Creado para la coherencia de los tamaños de fragmentos entre las entradas y los flujos de trabajo
El kit de preparación de bibliotecas TrueAmp Twist consigue tamaños de fragmentos de bibliotecas de ADN uniformes y un rendimiento suficiente en una amplia gama de entradas de muestras, lo que permite flujos de trabajo de entrada mixtos a la vez que se mantiene una cobertura uniforme y resultados reproducibles a escala.
Figura 4. Tamaño fiable de la biblioteca con el kit de preparación de bibliotecas TrueAmp Twist, incluso a partir de entradas ultrabajos. Se fragmentaron 500 ng, 100 ng, 50 ng, 10 ng y 1 ng (ADNg) a 32 °C. Se utilizaron 3, 5, 6, 8, 10 y 14 ciclos de PCR para la amplificación, respectivamente. Las muestras se realizaron por duplicado. (A) Electroferogramas de bibliotecas NGS generados con el kit de preparación de bibliotecas TrueAmp Twist. (B) Concentración de bibliotecas después de la amplificación con diversas entradas de ADN.
Tamaños de inserto controlados para un rendimiento ajustable
El kit de preparación de bibliotecas TrueAmp Twist ofrece tamaños de fragmentos de bibliotecas de ADN repetibles con una amplia gama de cantidades de entrada que respaldan la confianza en los resultados de la secuenciación y los análisis posteriores.
Figura 5. Regulabilidad del kit de preparación de bibliotecas TrueAmp de Twist. (A) Cinco electroferogramas de bibliotecas de NGS generadas con diferentes tiempos de fragmentación. Se fragmentaron 50 ng de ADNg de alta calidad durante diversos tiempos a 32 °C. Se utilizaron 6 ciclos de PCR para la amplificación. (B) Mediana del tamaño del inserto frente al tiempo. Se fragmentaron 50 ng de ADNg de alta calidad durante distintos tiempos a 32 °C. La amplificación se realizó mediante 6 ciclos de PCR. Las muestras se capturaron utilizando el panel Twist Exome 2.0.
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Alto rendimiento y cobertura cuando las muestras son más difíciles
El kit de preparación de bibliotecas TrueAmp ofrece un mayor rendimiento previo a la captura, tamaños de biblioteca uniformes y una cobertura media del objetivo más sólida a partir de ADN FFPE degradado y de baja entrada, lo que preserva la complejidad de la biblioteca y aumenta los resultados de secuenciación fiables en las muestras difíciles.
Cobertura uniforme con menor pérdida de objetivos
El kit de preparación de bibliotecas TrueAmp Twist consigue una mayor uniformidad de cobertura y menos regiones con cobertura cero. La reducción de las pérdidas del objetivo aumenta la confianza en una secuenciación coherente de las regiones críticas.
Cobertura mejorada en extremos de GC
La mezcla de polimerasas TrueAmp Twist obtiene una cobertura más uniforme en las regiones de GC alto y bajo, lo que mantiene el rendimiento incluso al aumentar los ciclos de PCR.
Creado para la coherencia de los tamaños de fragmentos entre las entradas y los flujos de trabajo
El kit de preparación de bibliotecas TrueAmp Twist consigue tamaños de fragmentos de bibliotecas de ADN uniformes y un rendimiento suficiente en una amplia gama de entradas de muestras, lo que permite flujos de trabajo de entrada mixtos a la vez que se mantiene una cobertura uniforme y resultados reproducibles a escala.
Tamaños de inserto controlados para un rendimiento ajustable
El kit de preparación de bibliotecas TrueAmp Twist ofrece tamaños de fragmentos de bibliotecas de ADN repetibles con una amplia gama de cantidades de entrada que respaldan la confianza en los resultados de la secuenciación y los análisis posteriores.
Creado para conseguir más: cobertura uniforme, rendimientos más altos y caracterización fiable de variantes
Cómo funciona
