人工遺伝子
オリゴプール
NGS
変異体配列ライブラリ
抗体
IVDRソリューション
Twist Bioscience本社
681 Gateway Blvd
South San Francisco, CA 94080
均一なカバレッジと確実なバリアントの検出
TrueAmp Library Prep Kit を使えば、次世代シーケンシング（NGS）ターゲットエンリッチメントワークフロー用の一貫した高品質ライブラリを構築できます。Twist TrueAmp ポリメラーゼを採用し、酵素による断片化に最適化されたこのワークフローは、高変換効率と低 GC バイアスを実現します。これらの特徴により、解析の難易度が高いゲノム領域全体にわたってバランスの取れたカバレッジが得られ、バリアントを信頼性高く特性評価するために必要な精度がもたらされます。
解析難易度の高い領域でも信頼できる均一性
カバレッジの一貫性に改善をもたらし、AT および GC 関連のドロップアウトを減らします。解析が困難なゲノム領域をより適切に網羅し、より包括的なシーケンシング結果を得ることができます。
効率的なサンプルの変換
低インプット、ホルマリン固定、パラフィン包埋（FFPE）、品質にばらつきのあるサンプルからのライブラリ収率を最大化します。貴重な出発物質を節約し、再実験の必要性を最小限に抑えます。
高忠実度の増幅
Twist TrueAmp ポリメラーゼにより、増幅によるエラーとバイアスを最小限に抑えます。低頻度バリアントの正確な検出を実現し、すべてのコールの信頼性を高めます。
製品データ
TrueAmp Library Prep Kit により、低インプットかつ劣化した FFPE DNA からのキャプチャ前の収量が増加し、一貫したライブラリサイズや、より強力な平均ターゲットカバレッジが得られます。そのためライブラリの複雑性が担保され、解析の難易度の高いサンプルから信頼性の高いシーケンシング結果が得られます。
図 1. 低インプット FFPE の劣化サンプル（DIN <2.2）を持つ濃縮ライブラリのパフォーマンスを、TrueAmp Library Prep Kit と競合他社の製品との間で比較し、解析困難なサンプル利用における最適ソリューションを示しました。(A) Twist TrueAmp Library Prep Kitが生み出す優れた捕捉前ライブラリ収量は、高いライブラリ構築と増幅効率を示しています。(B) Twist TrueAmp Library Prep Kit は、他社製品と比較して、より高いライブラリ複雑性を示しています。これにより、ライブラリ内でシーケンシング可能なユニーク DNA 分子の数を増やすことができ、シーケンシングコストを削減できる。(C) より高いカバレッジを実現します。
Twist TrueAmp Library Prep Kit は、カバレッジの均一性を向上させ、カバレッジのない領域を減らします。ターゲットのドロップアウトが減少することにより、重要な領域が一貫して解析され、信頼性が向上します。
図 2. 低インプット FFPE の劣化サンプル（DIN <2.2）を持つ濃縮ライブラリのパフォーマンスを、TrueAmp Library Prep Kit と競合他社の製品との間で比較し、解析困難なサンプル利用における最適ソリューションを示しました。(A) 優れたカバレッジ均一性を提供し、それは低いfold-80ベースペナルティの測定で表されます。(B) カバレッジのない領域が縮小しており、それはゼロカバレッジターゲット率の測定で表されます。
Twist TrueAmp Polymerase Mix は、GC 含量の高い領域と低い領域の双方でより均一なカバレッジを実現し、PCR サイクル数を増やしてもパフォーマンスを維持します。
図 3. Twist TrueAmp ポリメラーゼのカバレッジが向上したことを示す、GC バイアスの正規化トレース。Twist TrueAmp Library Prep Kit でライブラリを調製し、異なるポリメラーゼとサイクルで増幅しました。上部パネル：PCR を 3 サイクル行った場合のポリメラーゼの比較を示す、GC ウィンドウに対する正規化カバレッジ。下部パネル：PCR を 16 サイクル行った場合のポリメラーゼの比較を示す、GC ウィンドウに対する正規化カバレッジ。
Twist TrueAmp Library Prep Kit は、幅広いサンプルインプットの範囲で、DNA ライブラリの一貫した断片サイズと十分な収率を実現します。そのためスケールアップを行っても、均一なカバレッジと再現性ある結果が維持され、混合インプットワークフローが可能になります。
図 4. 超低インプット量でも信頼性の高いライブラリサイズを誇るTwist TrueAmp Library Prep Kit。500 ng、100 ng、50 ng、10 ng、1 ng（gDNA）を、32°Cで断片化しました。PCRでの増幅はそれぞれ3、5、6、8、10、14サイクル行いました。各サンプルは 2 回ずつ測定を行った。(A) Twist TrueAmp Library Prep Kitで作成されたNGSライブラリの電気泳動図。(B) 様々なDNAインプット量に対する増幅後のライブラリ濃度。
Twist TrueAmp Library Prep Kit により、幅広いインプット量で再現性のある DNA ライブラリ断片サイズを実現し、シーケンシング結果と下流の解析の信頼性を高めます。
図 5. Twist TrueAmp Library Preparation Kit のチューナビリティ。(A) 様々な断片化時間で生成したNGSライブラリの5つの電気泳動図。高品質gDNA 50 ngを32°Cで様々な時間で断片化しました。PCRでの増幅は6サイクル行いました。(B) 挿入サイズの中央値対時間。50ngの高品質の gDNA を、32°Cで様々な時間断片化しました。増幅は、6 サイクルの PCR を用いて実施。サンプルは Twist Exome 2.0 パネルを用いてキャプチャした。
ビデオ
最も解析困難なサンプルでの高収量と高カバレッジ
TrueAmp Library Prep Kit により、低インプットかつ劣化した FFPE DNA からのキャプチャ前の収量が増加し、一貫したライブラリサイズや、より強力な平均ターゲットカバレッジが得られます。そのためライブラリの複雑性が担保され、解析の難易度の高いサンプルから信頼性の高いシーケンシング結果が得られます。
図 1. 低インプット FFPE の劣化サンプル（DIN <2.2）を持つ濃縮ライブラリのパフォーマンスを、TrueAmp Library Prep Kit と競合他社の製品との間で比較し、解析困難なサンプル利用における最適ソリューションを示しました。(A) Twist TrueAmp Library Prep Kitが生み出す優れた捕捉前ライブラリ収量は、高いライブラリ構築と増幅効率を示しています。(B) Twist TrueAmp Library Prep Kit は、他社製品と比較して、より高いライブラリ複雑性を示しています。これにより、ライブラリ内でシーケンシング可能なユニーク DNA 分子の数を増やすことができ、シーケンシングコストを削減できる。(C) より高いカバレッジを実現します。
見逃しターゲットが少ない均一なカバレッジ
Twist TrueAmp Library Prep Kit は、カバレッジの均一性を向上させ、カバレッジのない領域を減らします。ターゲットのドロップアウトが減少することにより、重要な領域が一貫して解析され、信頼性が向上します。
図 2. 低インプット FFPE の劣化サンプル（DIN <2.2）を持つ濃縮ライブラリのパフォーマンスを、TrueAmp Library Prep Kit と競合他社の製品との間で比較し、解析困難なサンプル利用における最適ソリューションを示しました。(A) 優れたカバレッジ均一性を提供し、それは低いfold-80ベースペナルティの測定で表されます。(B) カバレッジのない領域が縮小しており、それはゼロカバレッジターゲット率の測定で表されます。
広範囲の GC 領域に対するカバレッジを改善
Twist TrueAmp Polymerase Mix は、GC 含量の高い領域と低い領域の双方でより均一なカバレッジを実現し、PCR サイクル数を増やしてもパフォーマンスを維持します。
図 3. Twist TrueAmp ポリメラーゼのカバレッジが向上したことを示す、GC バイアスの正規化トレース。Twist TrueAmp Library Prep Kit でライブラリを調製し、異なるポリメラーゼとサイクルで増幅しました。上部パネル：PCR を 3 サイクル行った場合のポリメラーゼの比較を示す、GC ウィンドウに対する正規化カバレッジ。下部パネル：PCR を 16 サイクル行った場合のポリメラーゼの比較を示す、GC ウィンドウに対する正規化カバレッジ。
インプットやワークフローを通して一貫した断片サイズが得られる設計
Twist TrueAmp Library Prep Kit は、幅広いサンプルインプットの範囲で、DNA ライブラリの一貫した断片サイズと十分な収率を実現します。そのためスケールアップを行っても、均一なカバレッジと再現性ある結果が維持され、混合インプットワークフローが可能になります。
図 4. 超低インプット量でも信頼性の高いライブラリサイズを誇るTwist TrueAmp Library Prep Kit。500 ng、100 ng、50 ng、10 ng、1 ng（gDNA）を、32°Cで断片化しました。PCRでの増幅はそれぞれ3、5、6、8、10、14サイクル行いました。各サンプルは 2 回ずつ測定を行った。(A) Twist TrueAmp Library Prep Kitで作成されたNGSライブラリの電気泳動図。(B) 様々なDNAインプット量に対する増幅後のライブラリ濃度。
パフォーマンスを調整できるよう制御された挿入サイズ
Twist TrueAmp Library Prep Kit により、幅広いインプット量で再現性のある DNA ライブラリ断片サイズを実現し、シーケンシング結果と下流の解析の信頼性を高めます。
図 5. Twist TrueAmp Library Preparation Kit のチューナビリティ。(A) 様々な断片化時間で生成したNGSライブラリの5つの電気泳動図。高品質gDNA 50 ngを32°Cで様々な時間で断片化しました。PCRでの増幅は6サイクル行いました。(B) 挿入サイズの中央値対時間。50ngの高品質の gDNA を、32°Cで様々な時間断片化しました。増幅は、6 サイクルの PCR を用いて実施。サンプルは Twist Exome 2.0 パネルを用いてキャプチャした。
1 / 5
最も解析困難なサンプルでの高収量と高カバレッジ
TrueAmp Library Prep Kit により、低インプットかつ劣化した FFPE DNA からのキャプチャ前の収量が増加し、一貫したライブラリサイズや、より強力な平均ターゲットカバレッジが得られます。そのためライブラリの複雑性が担保され、解析の難易度の高いサンプルから信頼性の高いシーケンシング結果が得られます。
見逃しターゲットが少ない均一なカバレッジ
Twist TrueAmp Library Prep Kit は、カバレッジの均一性を向上させ、カバレッジのない領域を減らします。ターゲットのドロップアウトが減少することにより、重要な領域が一貫して解析され、信頼性が向上します。
広範囲の GC 領域に対するカバレッジを改善
Twist TrueAmp Polymerase Mix は、GC 含量の高い領域と低い領域の双方でより均一なカバレッジを実現し、PCR サイクル数を増やしてもパフォーマンスを維持します。
インプットやワークフローを通して一貫した断片サイズが得られる設計
Twist TrueAmp Library Prep Kit は、幅広いサンプルインプットの範囲で、DNA ライブラリの一貫した断片サイズと十分な収率を実現します。そのためスケールアップを行っても、均一なカバレッジと再現性ある結果が維持され、混合インプットワークフローが可能になります。
パフォーマンスを調整できるよう制御された挿入サイズ
Twist TrueAmp Library Prep Kit により、幅広いインプット量で再現性のある DNA ライブラリ断片サイズを実現し、シーケンシング結果と下流の解析の信頼性を高めます。
より多くのことを可能にする設計：均一なカバレッジ、高収量、バリアントの確実な特性評価
ご利用方法
